Michael Clayton è un ex pubblico ministero che sbriga gli affari sporchi per uno dei più importanti studi legali di New York. Lo stesso studio che sta portando ad esito vittorioso una lunghissima causa ai danni della U/North, società che opera nel settore dei prodotti chimici per l'agricoltura, accusata di produrre cibi che causano il cancro. Ma l'avvocato Arthur Edens, stretto amico e collega di Michael ha un crollo psicologico che lo porta a sabotare l'intera causa. Marty Bach, co-fondatore dello studio, ricatta Michael, che ha bisogno di denaro per sistemare alcuni debiti, affinché faccia ragionare Edens. Ma quando Edens viene ucciso dai sicari della U/North, che tentano di far passare l'evento come suicidio, Michael decide di portare a termine quello che Arthur aveva iniziato.