Asuna, una giovane studentessa, dalla scomparsa di suo padre ha preso l'abitudine di isolarsi sulle colline. Lungo la strada verso il suo nascondiglio segreto viene aggredita da un mostro gigantesco ma viene salvata da Shun, un ragazzo dall'aspetto di un misterioso eroe. Prima di scomparire, il ragazzo le dice di provenire da un mondo dimenticato di nome Agartha. Con l'aiuto di uno dei suoi insegnanti Asuna parte alla ricerca della leggendaria terra degli dei, dove giace il segreto nascosto per riportare in vita le persone perdute. Un lungo viaggio alla ricerca di se stessi e dell'amore perduto.